Если условиями предварительного договора предусмотрено, что денежные средства в виде гарантийных платежей зачисляются в оплату имущества, то такая сумма гарантийных платежей увеличивает базу обложения НДС у плательщика. Так в случае изменения направления использования полученного ранее гарантийного платежа, который в начале выполнял функцию средств обеспечения основного договора, и в дальнейшем направляется в счет оплаты за имущество, что должно быть обусловлено дополнительным соглашением к договору, на дату изменения направления использования гарантийного платежа плательщик обязан начислить налоговые обязательства по НДС на сумму полученных гарантийных платежей.

Если условиями договора предусмотрено, что гарантийный платеж выполняет исключительно функцию средства обеспечения исполнения обязательств и подлежит возврату после подписания основного договора, то такая сумма гарантийных платежей не увеличивает базу обложения НДС.